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https://pgc-snia.inia.gob.pe:8443/jspui/handle/pubitem/2404
Campo DC | Value | Idioma |
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dc.contributor.author | Cordova Campos, Jose Stalyn | - |
dc.contributor.author | Calle Ulfe, Pedro G. | - |
dc.contributor.author | Suárez Peña, Erick Antonio | - |
dc.contributor.author | Mendez Farroñan, Sandra Johana | - |
dc.contributor.author | Lindo Seminario, David Enrique | - |
dc.contributor.author | Gutiérrez Calle, Savina Alejandra | - |
dc.contributor.author | Morales Pizarro, Arturo | - |
dc.contributor.author | Cedeño Escobar, Virna | - |
dc.contributor.author | Mialhe Matonnier, Eric | - |
dc.contributor.author | Condemarín Montealegre, Carlos | - |
dc.date.accessioned | 2023-03-01T19:54:48Z | - |
dc.date.available | 2023-03-01T19:54:48Z | - |
dc.date.issued | 2023-01-15 | - |
dc.identifier.citation | Córdova, J.; Calle, P.; Suarez, E.; Mendez, S.; Lindo, D.; Gutiérrez, S.; Morales, A.; Cedeño, V.; Mialhe, E. & Condemarín, C. (2023). Identificación de proteínas efectoras mediante espectrometría de masas MALDI TOF/TOF del nematodo agallador de la raíz Meloidogyne javanica. Tropical and Subtropical Agroecosystems, 26(1). doi: 10.56369/tsaes.4518 | es_PE |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12955/2092 | - |
dc.description.abstract | La principal problemática del cultivo de vid son los nematodos agalladores de la raíz causan serios problemas en el rendimiento en la mayoría de cultivos en todo el mundo. A través de sus diferentes mecanismos de infección estos nematodos sintetizan y secretan una mezcla de efectores a base de compuestos proteicos que utilizan para penetrar la raíz, migrar y desarrollarse en células gigantes de alimentación radicular en las plantas hospederas. El uso de nuevas herramientas moleculares como la espectrometría de masas MALDI TOF/TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - Time-Of-Flight) y la técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction) han permitido conocer estas proteínas y genes en diferentes microorganismos. Objetivo: Caracterizar al nematodo agallador de la raíz Meloidogyne javanica mediante la secuenciación del gen ARNr 18S a partir de muestras radiculares infectadas y las proteínas efectoras de juveniles (J2) y adultas (J4) estadio de M. javanica mediante la espectrometría doble masa MALDI TOF/TOF de tipo shotgun proteomics. Metodología: Las raíces infectadas del cultivo de vid fueron colectadas para extraer agallas y J2 frescos de M. javanica, posteriormente se inocularon en plantas de tomate. Se utilizaron J4 de M. javanica para la extracción del ADN genómico y su secuenciamiento a nivel del gen ARNr 18S. Los estadios J2 y J4 de M. javanica, se desinfectaron con hipoclorito de sodio (0,5%) y agua destilada estéril, para la extracción y análisis de proteínas con MALDI-TOF/TOF. Por último, las secuencias obtenidas fueron procesadas con los softwares ProteinPilot™ y Protein BLAST para la identificación de proteínas efectores de M. javanica. Resultados: Se identificó molecularmente, a través de la amplificación por PCR del gen ADNr 18S al nemátodo M. javanica con un porcentaje de identidad de 98% a partir de muestras radiculares infectadas y mediante espectrometría de masas MALDI TOF/TOF, se identificaron secuencias proteicas efectoras tales como: Beta-1,4-endoglucanas y polygalaturonasa, identificadas a partir de J2, y la expansin B2, CLAVATA3/ESR, Pectato lyasa y Chorismato mutasa a partir de J4, involucradas en los diversos procesos de infección. Además, se lograron identificar 49 proteínas no efectoras del nematodo en ambos estadios relacionadas al desarrollo biológico conservado. Implicaciones: Los resultados indican la existencia de proteínas efectoras relacionadas a la formación de agallas de la raíz. Conclusiones: Este estudio confirman que la metodología de espectrometría de doble masa proporciona de una forma rápida y reproducible un perfil proteómico que el nematodo agallador sintetiza para infectar las células radiculares y que puede ser usado en otros tipos de patógenos. | es_PE |
dc.format | application/pdf | - |
dc.language.iso | spa | - |
dc.publisher | Universidad Autónoma de Yucatán | es_PE |
dc.relation.ispartof | Tropical and Subtropical Agroecosystems | en |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | - |
dc.source | Instituto Nacional de Innovación Agraria | es_PE |
dc.source.uri | Repositorio Institucional - INIA | es_PE |
dc.subject | Proteómica | es_PE |
dc.subject | Nematodos | - |
dc.subject | Perfiles peptídicos | - |
dc.title | Identificación de proteínas efectoras mediante espectrometría de masas MALDI TOF/TOF del nematodo agallador de la raíz Meloidogyne javanica | es_PE |
dc.title.alternative | Identification of effecting proteins by MALDI TOF/TOF mass spectrometry of the root-knot nematode Meloidogyne javanica | en |
dc.type | info:eu-repo/semantics/article | es_PE |
dc.identifier.doi | 10.56369/tsaes.4518 | - |
dc.subject.ocde | https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.01 | - |
dc.publisher.country | MX | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
item.languageiso639-1 | es | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.openairetype | info:eu-repo/semantics/article | - |
item.fulltext | Con texto completo | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
crisitem.author.dept | Dirección de Supervisión y Monitoreo en las Estaciones Experimentales Agrarias - DSME | - |
crisitem.author.dept | Dirección de Recursos Genéticos y Biotecnología - DRGB | - |
crisitem.author.dept | Dirección de Recursos Genéticos y Biotecnología - DRGB | - |
crisitem.author.dept | Dirección de Recursos Genéticos y Biotecnología - DRGB | - |
crisitem.author.orcid | 0000-0002-5891-4679 | - |
crisitem.author.orcid | 0000-0003-0137-8251 | - |
crisitem.author.orcid | 0000-0002-5214-8993 | - |
crisitem.author.orcid | 0000-0002-8767-5304 | - |
crisitem.author.orcid | 0000-0003-1077-9153 | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA | - |
crisitem.author.parentorg | Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA | - |
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