Characterization of the complete mitochondrial genome of the black Alpaca breed of Vicugna pacos (Mammalia, Artiodactyla, Camelidae) from Puno, Peru

Abstract

The domestic South American camelid Vicugna pacos L. is distributed along Peru, Chile, Bolivia, and Argentina. Here, we contribute to the bioinformatics and evolutionary systematics of the Camelidae by performing high-throughput sequencing analysis on the black Huacaya breed of V. pacos from Puno, Peru. The black Huacaya breed mitogenome is 16,664 base pairs (bp) in length and contains 37 genes (GenBank accession MT044302). The mitogenome shares a high-level of gene synteny to other Camelidae (Camelops, Camelus, Lama, and Vicugna). The mitogenome of the black Huacaya breed of V. pacos situates it in a clade with V. vicugna Molina, sister to Lama. We anticipate that further mitogenome sequencing of different breeds from Vicugna pacos will improve our understanding of the evolutionary history of this taxon.

El camélido doméstico sudamericano Vicugna pacos L. se distribuye a lo largo de Perú, Chile, Bolivia y Argentina. Aquí, contribuimos a la bioinformática y la sistemática evolutiva de los Camelidae mediante la realización de análisis de secuenciación de alto rendimiento en la raza Huacaya negra de V. pacos de Puno, Perú. El mitogenoma de la raza Huacaya negra tiene una longitud de 16.664 pares de bases (pb) y contiene 37 genes (acceso GenBank MT044302). El mitogenoma comparte un alto nivel de sintenia génica con otros Camelidae (Camelops, Camelus, Lama y Vicugna). El mitogenoma de la raza Huacaya negra de V. pacos la sitúa en un clado con V. vicugna Molina, hermana de Lama. Prevemos que la secuenciación adicional del mitogenoma de diferentes razas de Vicugna pacos mejorará nuestra comprensión de la historia evolutiva de este taxón.