Perspectives in Myrtaceae evolution from plastomes and nuclear phylogenies

Abstract

Myrtaceae is a large and species-rich family of woody eudicots, with prevalent distribution in the Southern Hemisphere. Classification and taxonomy of species belonging to this family is quite challenging, sometimes with difficulty in species identification and producing phylogenies with low support for species relationships. Most of the current knowledge comes from few molecular markers, such as plastid genes and intergenic regions, which can be difficult to handle and produce conflicting results. Based on plastid protein-coding sequences and nuclear markers, we present a topology for the phylogenetic relationships among Myrtaceae tribes. Our phylogenetic estimate offers a contrasting topology over previous analysis with fewer markers. Plastome phylogeny groups the tribes Syzygieae and Eucalypteae and individual chloroplast genes produce divergent topologies, especially among species within Myrteae tribe, but also in regard to the grouping of Syzygieae and Eucalypteae. Results are consistent and reproducible with both nuclear and organellar datasets. It confronts previous data about the deep nodes of Myrtaceae phylogeny.

Myrtaceae es una familia grande y rica en especies de eudicotas leñosas, con una distribución predominante en el hemisferio sur. La clasificación y la taxonomía de las especies pertenecientes a esta familia es bastante desafiante, a veces con dificultad en la identificación de las especies y produciendo filogenias con poco apoyo para las relaciones entre las especies. La mayor parte de los conocimientos actuales proceden de unos pocos marcadores moleculares, como los genes de los plástidos y las regiones intergénicas, que pueden ser difíciles de manejar y producir resultados contradictorios. Basándonos en las secuencias de codificación de proteínas de los plástidos y en los marcadores nucleares, presentamos una topología para las relaciones filogenéticas entre las tribus de Myrtaceae. Nuestra estimación filogenética ofrece una topología contrastada respecto a los análisis anteriores con menos marcadores. La filogenia del plastoma agrupa a las tribus Syzygieae y Eucalypteae y los genes individuales del cloroplasto producen topologías divergentes, especialmente entre las especies dentro de la tribu Myrteae, pero también respecto a la agrupación de Syzygieae y Eucalypteae. Los resultados son consistentes y reproducibles con los conjuntos de datos nucleares y organelares. Confrontan los datos anteriores sobre los nodos profundos de la filogenia de Myrtaceae.