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https://pgc-snia.inia.gob.pe:8443/jspui/handle/20.500.12955/1662
Title: | Chloroplast genome of Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) a species adapted to the hyper-arid conditions of the Atacama and Peruvian desert | Other Titles: | Genoma del cloroplasto de Tillandsia landbeckii Phil. (Bromeliaceae) una especie adaptada a las condiciones hiperáridas del desierto de Atacama y Perú | Authors: | Chávez Galarza, Julio César Cardenas Ninasivincha, Stefanny Contreras Díaz, Roberto Ferro Mauricio, Rubén Darío Huanca Mamani, Wilson |
Keywords: | Chloroplast genome;Tillandsia landbeckii | Issue Date: | 10-Nov-2021 | Publisher: | Taylor & Francis | Source: | Chávez-Galarza, J. C., Cardenas-Ninasivincha, S., Contreras, R., Ferro-Mauricio, R., & Huanca-Mamani, W. (2021). Chloroplast genome of Tillandsia landbeckii Phil.(Bromeliaceae) a species adapted to the hyper-arid conditions of the Atacama and Peruvian desert. Mitochondrial DNA Part B, 6(12), 3375-3377. 10.1080/23802359.2021.1997122 | Journal: | Mitochondrial DNA Part B | Abstract: | Tillandsia landbeckii Phil. is a vulnerable species belonging to the terrestrial Bromeliaceae family; it is highly adapted to extremely hyper-arid conditions of the Atacama Desert and Peruvian deserts. In this study, we sequenced, assembled, and annotated its chloroplast genome. T. landbeckii chloroplast genome is 159,131 bp in length, containing a large single-copy region of 87,164 bp, a small single-copy region of 18,521 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,723 bp. The GC content of the chloroplast genome is 37.33%. It encodes a total of 132 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes and 8 rRNA genes. The phylogenetic tree indicates that T. landbeckii is placed within the Bromeliaceae family and has a close relationship with T. marconae with 100% support. Tillandsia landbeckii Phil. es una especie vulnerable perteneciente a la familia de las Bromeliaceae terrestres; está muy adaptada a las condiciones extremadamente hiperáridas del desierto de Atacama y los desiertos peruanos. En este estudio, secuenciamos, ensamblamos y anotamos su genoma del cloroplasto. El genoma del cloroplasto de T. landbeckii tiene una longitud de 159.131 pb, y contiene una región grande de una sola copia de 87.164 pb, una región pequeña de una sola copia de 18.521 pb, y un par de regiones de repetición invertida de 26.723 pb. El contenido de GC del genoma del cloroplasto es del 37,33%. Codifica un total de 132 genes, incluyendo 86 genes codificadores de proteínas, 38 genes de ARNt y 8 genes de ARNr. El árbol filogenético indica que T. landbeckii se sitúa dentro de la familia Bromeliaceae y tiene una estrecha relación con T. marconae con un apoyo del 100%. |
Description: | 3 páginas |
URI: | https://hdl.handle.net/20.500.12955/1662 | ISSN: | 2380-2359 | DOI: | https://doi.org/10.1080/23802359.2021.1997122 | Rights: | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Appears in Collections: | Artículos científicos |
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