Chloroplast genome of Tillandsia marconae till & Vitek (Bromeliaceae), a hyperarid desert endangered species

Abstract

Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) is a rare plant native species that grows over sand, in the coastal desert from Perú and Chile and is considered an endangered species. In this study, we assembled its chloroplast genome. The draft chloroplast genome of T. marconae is ca. 158,873 bp in length, containing a large single-copy region of 86,937 bp, a small single-copy region of 18,506 bp, and a pair of inverted repeat regions of 26,715 bp. The GC content of the draft chloroplast genome is 37.4%. It encodes a total of 135 genes, including 86 protein-coding genes, 38 tRNA genes, 8 rRNA genes, and three pseudogenes. The phylogenetic tree indicated that T. marconae is placed within the Bromeliaceae family and a close relationship with Tillandsia usneoides with 100% support.

Tillandsia marconae Till & Vitek (Bromeliaceae) es una especie nativa de planta rara que crece sobre la arena, en el desierto costero de Perú y Chile y se considera una especie en peligro de extinción. En este estudio, ensamblamos su genoma del cloroplasto. El borrador del genoma del cloroplasto de T. marconae tiene una longitud de aproximadamente 158.873 pb, y contiene una región grande de copia única de 86.937 pb, una región pequeña de copia única de 18.506 pb, y un par de regiones de repetición invertida de 26.715 pb. El contenido de GC del borrador del genoma del cloroplasto es del 37,4%. Codifica un total de 135 genes, incluyendo 86 genes codificadores de proteínas, 38 genes de ARNt, 8 genes de ARNr y tres pseudogenes. El árbol filogenético indicó que T. marconae se sitúa dentro de la familia Bromeliaceae y una estrecha relación con Tillandsia usneoides con un apoyo del 100%.