The complete chloroplast genome of the national tree of Peru, quina (Cinchona officinalis L., Rubiaceae)

Abstract

Here, we report the first complete chloroplast (cp) genome of Cinchona officinalis. This cp genome has a 156,984 bp in length with typical quadripartite structure, containing a large single copy (LSC) region (83,929 bp) and an 18,051 bp small single-copy (SSC) region, separated by two inverted repeat (IR) regions (27,502 bp). The total GC content was 37.75%. Quina tree chloroplast genome possesses 135 genes that consisted of 89 protein-coding genes, 37 tRNA, eight rRNA, and one pseudogene. Phylogenetic analysis showed that C. officinalis is sister to C. pubescens and sister to them is Isertia laevis; all belong to the Cinchonoideae sub-family.

Aquí, informamos del primer genoma completo del cloroplasto (cp) de Cinchona officinalis. Este genoma del cp tiene una longitud de 156.984 pb con una estructura típica cuatripartita, que contiene una región de copia única grande (LSC) (83.929 pb) y una región de copia única pequeña (SSC) de 18.051 pb, separadas por dos regiones de repetición invertida (IR) (27.502 pb). El contenido total de GC fue del 37,75%. El genoma del cloroplasto del árbol de Quina posee 135 genes que consisten en 89 genes codificadores de proteínas, 37 ARNt, ocho ARNr y un pseudogen. El análisis filogenético mostró que C. officinalis es hermana de C. pubescens y hermana de ellas es Isertia laevis; todas pertenecen a la subfamilia Cinchonoideae.