Paternal ancestry of Peruvian creole cattle inferred from Y-chromosome analysis

Abstract

The aim of this study was the identification of the genetic diversity and paternal origin of Peruvian creole cattle. A panel of 7 Y-chromosome specific markers (INRA189, UMN0103, BM861, UMN307, BYM-1, DDX3Y_1STR and ZFY10) were analyzed in 229 cattle from 6 regions of the Peruvian highlands. The creole cattle exhibited low genetic diversity (H= 0.50) mostly explained by within-population variation (98%) and absence of population structure (FST = 0.019) in the analyzed regions. These results are in concordance to other studies in Spanish cattle populations. The overall frequency and distribution of the major B. taurus haplogroups: Y1 (19%) and Y2 (81%), suggests that Peruvian creole cattle derived from the Iberian Peninsula cattle. Furthermore, our results some degree of male-mediated African cattle influence in the Peruvian creoles, supporting the findings of other studies in South American creole cattle populations. Altogether, our results revealed unique genetic characteristics of Peruvian creole cattle that may have important implications for future conservation programs.

El objetivo de este estudio fue la identificación de la diversidad genética y el origen paterno del ganado criollo peruano. Se analizó un panel de 7 marcadores específicos del cromosoma Y (INRA189, UMN0103, BM861, UMN307, BYM-1, DDX3Y_1STR y ZFY10) en 229 bovinos de 6 regiones de la sierra peruana. El ganado criollo exhibió baja diversidad genética (H= 0.50) explicada mayormente por variación intrapoblacional (98%) y ausencia de estructura poblacional (FST = 0.019) en las regiones analizadas. Estos resultados están en concordancia con otros estudios en poblaciones ganaderas españolas. La frecuencia global y la distribución de los principales haplogrupos de B. taurus: Y1 (19%) e Y2 (81%), sugiere que el ganado criollo peruano derivó del ganado de la Península Ibérica. Además, nuestros resultados muestran cierto grado de influencia masculina de ganado africano en los criollos peruanos, apoyando los hallazgos de otros estudios en poblaciones de ganado criollo sudamericano. En conjunto, nuestros resultados revelaron características genéticas únicas del ganado criollo peruano que pueden tener importantes implicaciones para futuros programas de conservación.